Gerühmt und bewundert für seine universelle Bildung und seinen Wissensdurst, gefürchtet und gehaßt für seinen Machthunger und seine Brutalität: Kaiser Friedrich II. von Hohenstaufen, das Staunen und der Hammer der Welt". Der Film begibt sich auf die Spur dieses großartigen Herrschers. Messungen von Astronomen enthüllen das sagenumwobene Castel del Monte - das Bauwerk Friedrichs - als gigantische Sonnenuhr aus Stein. 800 Jahre alte Mordanklagen gegen den Kaiser müssen den neuesten wissenschaftlichen Ergebnissen standhalten, wenn das exhumierte Skelett seiner Ehefrau auf Giftspuren untersucht wird. Bisher noch nie gefilmte Dokumente aus dem Geheimarchiv des Vatikan zeigen das "Genie auf dem Kaiserthron" als modernen Wissenschaftler. Wer war dieser legendäre Herrscher, der letzte große römisch-deutsche Kaiser der Welt, der bis heute zu den schillerndsten Gestalten der Geschichte gehört?